在每年畢業申請時，有一些考生因課程頂替問題而無法確認畢業資格。北京教育考試院自考辦有關負責人介紹，專業計劃課程調整后，現執行期的課程只能與上一執行期銜接。
考生判斷自己取得的成績是否有效，要按照“ABC”原則進行確認。假如考生已經取得A課程的合格成績，后來B課程在考試計劃中取代了A課程，A課程與B課程分屬于相鄰的兩個計劃執行內，A課程的成績此時就可以頂替新設置的B課程，因而繼續有效。如考試計劃再次變化，B課程又被更新的C課程所頂替，A與C課程分屬的計劃執行期并不相鄰，則A課程的成績就不能繼續使用。
面臨課程銜接的考生要在畢業申請前確認自己的課程成績是否仍然有效，但是考生要注意一些新舊課程頂替的特殊關系。個別課程名稱、代碼調整為C課程，但實質上和B課程的教材、大綱、學分一樣，這樣的課程應和A有頂替關系。目前這種課程共有9門：操作系統=操作系統（一）可替代A課程，數據結構=數據結構（一）可替代A課程，離散數學=離散數學（一）可替代A課程，軟件工程=軟件工程（一）可替代A課程，數據庫原理=數據庫原理（一）可替代A課程，法理學=法理學（一）可替代A課程，憲法學=憲法學（一） 可替代A課程，金融法=金融法（一）可替代A課程，婚姻家庭法=婚姻家庭法（一）可替代A課程。另外，護理專業（本科）婦產科護理學（一）、外科護理學（一）、兒科護理學（一）等3門課程2001年的考試成績可以替代現計劃中的婦產科護理學（二）、外科護理學（二）、兒科護理學（二）的成績，語文、大學語文、大學語文（4學分）、大學語文（6學分）、大學語文（專）、大學語文（本）、大學語文（全國）等舊課程均可頂替現在的大學語文（4學分）。
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